Территория современного муниципального образования Таштагольский район до 1939 г. входила в Горно-Шорский район Новосибирской области. Указом Президиума Верховного Совета РСФСР от 22 марта 1939г. Горно-Шорский район был разделен на Мысковский, Таштагольский и Кузедеевский Новосибирской области. Указом Президиума Верховного Совета РСФСР от 26января 1943г.

Таштагольский район был включен состав Кемеровской области, которая согласно данному законодательному акту выделилась из состава Новосибирской области. Состав Таштагольского района в этот период был представлен рядом различных по масштабу территории районных поселков, в том числе Шерегеш, Темир-Тау, Каз, Мундыбаш, Спасск, Чугунаш и др. 

Возникновение и становление этих поселков определялось развитием в них различных отраслей горнорудной и золотодобывающей промышленности. В 1960г. поселки Таштагол и Кочура объединены в районный поселок Таштагол. Указом Президиума Верховного Совета РСФСР от 1 февраля 1963 г. «Об укрупнении районов, образовании промышленных районов и изменении подчиненности районов и городов Кемеровской области» рабочие поселки Таштагол и Шалым преобразованы в город областного подчинения Таштагол.

На основании Федерального закона от 6 октября 2003 года № 131-ФЗ «Об общих принципах местного самоуправления в Российской Федерации» и областного закона от 17 декабря 2004 года № 104-ОЗ «О статусе и границах муниципальных образований» Таштагольский район наделен статусом муниципального образования с административным центром г.Таштагол.

На территории Таштагольского района образованы следующие муниципальные образования, которым придан статус городских и сельских поселений.